يعود انشاء الإدارة في سنواتها الأولى منذ افتتاح الجامعة في عام 1377هـ وكانت تسمى في ذلك الوقت بإدارة الحركة، وبعد التطور الانشائي والاقتصادي في الجامعة تم تغيير المسمى إلى إدارة النقل، وتعتبر الإدارة هي الجهة المسؤولة عن جميع وحدات النقل في الجامعة وتقوم بمجهودات كبيرة ومهمة لكل الجهات في الجامعة، حيث يتم من خلالها إدارة وحدات النقل التابعة لها ومراقبة تحركات المركبات وكل ما يخص النقل الجامعي من خلال حركة السيارات والرحلات العلمية والضيافة والزيارات الرسمية وغيرها مما يخدم عدة مجالات الجامعة، كما تشرف الإدارة على صيانة المركبات وتزويدها بالوقود والزيوت والمتابعة الدورية لها وفق أنظمة وجداول محددة لكل مركبة وذلك خلال الرقم الجامعي الخاص لكل سيارة.