يعود انشاء الإدارة في سنواتها الأولى منذ افتتاح الجامعة في عام 1377هـ وكانت تسمى في ذلك الوقت بإدارة الحركة، وبعد التطور الانشائي والاقتصادي في الجامعة تم تغيير المسمى إلى إدارة النقل، وتعتبر الإدارة هي الجهة المسؤولة عن جميع وحدات النقل في الجامعة وتقوم بمجهودات كبيرة ومهمة لكل الجهات في الجامعة، حيث يتم من خلالها إدارة وحدات النقل التابعة لها ومراقبة تحركات المركبات وكل ما يخص النقل الجامعي من خلال حركة السيارات والرحلات العلمية والضيافة والزيارات الرسمية وغيرها